姓名:吴璟莉

学位/职称:博士/教授

电子邮箱:wjlhappy@mailbox.gxnu.edu.cn               

研究领域:计算机算法与优化、生物信息学、智能优化算法


个人简介

吴璟莉,女,19781月出生。博士,教授,博士生导师,现任广西师范大学计算机科学与工程学院党委书记,广西本科高校计算机类教学指导委员会委员广西高等教育学会计算机基础教育专委会副秘书长,广西人工智能学会理事2008年毕业于中南大学信息科学与工程学院,计算机应用专业,获工学博士学位。200912月晋升为副教授,201412月晋升为教授。目前主要从事计算机算法与优化、生物信息学、智能优化算法等方面的研究。先后主持国家自然科学基金项目3项、省部级项目3项,地厅级项目3项、校级项目5项;参与国家级、省部级项目8。在国内外权威期刊和国际知名会议上发表录用论文60余篇,其中SCI收录16篇,EI收录20多篇,获国家发明专利授权3项。

学习和工作经历

19969月–20006广西大学,计算机与信息工程学院,计算机软件,工学学士

20009月–20036广西大学,计算机与信息工程学院,控制理论与控制工程,工学硕士

20037月–20058月,广西师范大学,数学与计算机科学学院,讲师

20059月–200812中南大学, 信息科学与工程学院,计算机应用,工学博士

2009年1月–2009年11月,广西师范大学,计算机科学与信息工程学院,讲师

200912月–201411广西师范大学,计算机科学与信息工程学院,副教

201412月–至今, 广西师范大学,计算机科学与工程学院,教授

研究兴趣

计算机算法与优化、生物信息学、智能优化算法

主要研究项目

  1. 基于群智能优化和深度学习的泛癌驱动通路识别研究,国家自然科学基金项目,编号:62366007,主持,2024-2027

  2. 基于高通量多组学数据的癌症驱动通路识别算法研究,国家自然科学基金项目,编号:61762015,主持,2018-2021

  3.基于新一代测序技术的K单体型组装算法研究,国家自然科学基金项目,编号:61363035,主持,2014-2017

  4. 面向多源异构组学数据的泛癌驱动通路识别问题研究,广西自然科学基金项目,编号:2022GXNSFAA035625,主持,2022-2025

  5.基于新一代测序技术的病毒准种单体型组装算法研究,广西自然科学基金项目,编号:2015GXNSFAA139288,主持,2015-2018

  6.生物信息处理的组装算法研究,广西多源信息挖掘与安全重点实验室系统性研究基金项目(14-A-03-02),主持,2014-2016

  7.多倍体个体SNP 单体型检测的有效计算模型和算法研究,广西高等学校科学技术项目(2013YB028),主持,2013-2015  

  8.基于进化计算的三倍体个体单体型检测算法研究,广西自然科学基金项目(2011GXNSFB018068)主持,2011- 2014

  9.地方高校数据库系列课程的整合与优化,广西高等教育教学改革工程一般A类项目(2012JGA120),主持,2012-2014

  10.生物信息学中的相关组合理论和算法研究,国家自然科学基金重点项目(60433020),主要参与,2005-2008

主要科研论文

1Jingli Wu, Qinghua Nie, Gaoshi Li, Kai Zhu:Identifying driver pathways based on a parameter-free model and a partheno-genetic algorithm. BMC Bioinform. 24(1): 211 (2023) (CCF C)

2 Rongyuan Li, Jingli Wu*, Gaoshi Li, Jiafei Liu, Junbo Xuan, Qi Zhu:Mdwgan-gp: data augmentation for gene expression data based on multiple discriminator WGAN-GP. BMC Bioinform. 24(1): 427 (2023) (CCF C)

3 Kai Zhu, Jingli Wu*, Gaoshi Li, Xiaorong Chen, Michael Yourong Luo:A model and cooperative co-evolution algorithm for identifying driver pathways based on the integrated data and PPI network. Expert Syst. Appl. 212: 118753 (2023) (中科院SCI一区)

4 Jingli Wu, Xiaorong Chen, Gaoshi Li, Zheng Deng,  Kai Zhu. A Nonlinear Model and an Algorithm for Identifying Cancer Driver Pathways. Appl. Soft Comput. 129: 109578 (2022) (中科院SCI二区)

5 Jingli Wu, Cong Wu, Gaoshi Li. Identifying common driver modulesby equilibrating coverage and mutual exclusivity across pan-cancer data. Neurocomputing 492: 408-420 (2022)  (中科院SCI二区)

6 Jingli Wu, Qi Zhang, Gaoshi Li. Identification of Cancer-RelatedModule in Protein-Protein Interaction Networks Based on GenePrioritization. Journal of Bioinformatics and Computational Biology.https://doi.org/10.1142/S0219720021500311, 2022,  20(01):2150031.(SCI)

7 Jingli Wu, Jifan Yang, Gaoshi Li, Jinyan Wang. IDM-SPS:Identifying driver module with somatic mutation, PPI network and subcellularlocalization, Engineering Applications of Artificial Intelligence. https://doi.org/10.1016/j.engappai.2021.104482 (中科院SCI二区)

8 Jingli Wu, Kai Zhu, Gaoshi Li,YinyanWang, Qirong Cai. A Modeland Algorithm for Identifying Driver Pathways Based on Weighted Non-binaryMutation Matrix, Applied Intelligence. 2021, DOI:10.1007/s10489-021-02330-5(中科院SCI二区)

9 Jingli Wu, Ke Pan, Gaoshi Li, Kai Zhu, Qirong Cai. Two NovelModels and a Parthenogenetic Algorithm for Detecting Common Driver Pathwaysfrom Pan-Cancer Data, Engineering Applications of Artificial Intelligence,Volume 96, November 2020, 104010 (中科院SCI二区)

10 Jingli Wu,Yong Wu. Practical Algorithms for allocating theroadside infrastructure in VANETs,  IET Intelligent Transport Systems,2020,14(2): 103-109(SCI)

11 Jingli Wu, Ke Pan, Kai Zhu, Qirong Cai. Identifying Common DriverPathways based on Pan-cancer Data.Proceedings of 2019 IEEE InternationalConference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2019), San Diego,California, USA, November 18-21 , 2019, pp. 542--547. (CCF B 类会议,EI)

12 Jingli Wu, Qirong Cai, Jinyan Wang, Yuanxiu Liao.Identifyingmutated driver pathways in cancer by integrating multi-omics data, the 17thAsia Pacific Bioinformatics Conference (APBC 2019), Computational Biology andChemistry, 2019, 80: 159-167 (CCF C类会议, SCI+EI)

13 Jingli Wu,Qian Zhang. A Fast and Accurate Enumeration-basedAlgorithm for Haplotyping a Triploid Individual, Algorithms for MolecularBiology, 2018,13(1):10 (SCI)

14 Jingli Wu,Yong Wu. A parthenogenetic algorithm for Deploying theRoadside Units in Vehicle Networks,In:Liu W., Giunchiglia F., Yang B. (eds) Proceedings of Knowledge Science,Engineering and Management, 2018. (CCF C类会议,EI)

15 Jingli Wu, Xixi Chen and Xianchen Li. Haplotyping a singletriploid individual based on genetic algorithm. Bio-MedicalMaterials and Engineering, 2014, 24(6): 3753–3762. (SCI)

16 Jingli Wu, Binbin Liang. A Fast and Accurate Algorithm for Individual haplotype Reconstruction, Journal of Bioinformatics and Computational Biology,11(4): 1350010, 2013. (SCI)

17 JingliWu,Jian Xin Wang,Jian’er Chen. A Heuristic Algorithm for Haplotype Reconstructionfrom Aligned Weighted SNP Fragments. International Journal of BioinformaticsResearch and Applications, 2013,9(1): 13-24

18 JingliWu, Jianxin Wang and Jian’er Chen. A ParthenogeneticAlgorithm for Single Individual SNP Haplotyping. Engineering Applications ofArtificial Intelligence, 2009, 22(3):401-406 (中科院SCI二区)

19 JingliWu, Jianxin Wang and Jian’er Chen. A Practical AlgorithmBased on Particle Swarm Optimization for Haplotype Reconstruction. AppliedMathematics and Computation, 2009, 28(2): 363-372 (中科院SCI一区)

20 JingliWu, Jianxin Wang and Jian’er Chen. A Practical Algorithm forMultiplex PCR Primer Set Selection. International Journal of BioinformaticsResearch and Applications, 2009,5(1): 38-49 (EI)

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