姓名：吴璟莉
学位/职称：博士/教授
电子邮箱：wjlhappy@mailbox.gxnu.edu.cn
研究领域：计算机算法与优化、生物信息学、智能优化算法
个人简介
吴璟莉，女，1978年1月出生。博士，教授，博士生导师，现任广西师范大学计算机科学与工程学院党委书记，广西本科高校计算机类教学指导委员会委员，广西高等教育学会计算机基础教育专委会副秘书长，广西人工智能学会理事。2008年毕业于中南大学信息科学与工程学院，计算机应用专业，获工学博士学位。目前主要从事计算机算法与优化、生物信息学、智能优化算法等方面的研究。先后主持国家自然科学基金项目3项、省部级项目3项，地厅级项目3项；参与国家级、省部级项目8项。在国内外权威期刊和国际知名会议上发表录用论文60余篇，其中SCI收录21篇，EI收录20多篇，获国家发明专利授权4项。
学习和工作经历
1996年9月–2000年6月，广西大学，计算机与信息工程学院，计算机软件，工学学士
2000年9月–2003年6月，广西大学，计算机与信息工程学院，控制理论与控制工程，工学硕士
2003年7月–2005年8月，广西师范大学，数学与计算机科学学院，讲师
2005年9月–2008年12月，中南大学, 信息科学与工程学院，计算机应用，工学博士
2009年1月–2009年11月，广西师范大学，计算机科学与信息工程学院，讲师
2009年12月–2014年11月，广西师范大学，计算机科学与信息工程学院，副教授
2014年12月–至今, 广西师范大学，计算机科学与工程学院，教授
研究兴趣
计算机算法与优化、生物信息学、智能优化算法
主要研究项目
1. 基于群智能优化和深度学习的泛癌驱动通路识别研究，国家自然科学基金项目，编号：62366007，主持，2024-2027
2. 基于高通量多组学数据的癌症驱动通路识别算法研究，国家自然科学基金项目，编号：61762015，主持，2018-2021
3.基于新一代测序技术的K单体型组装算法研究，国家自然科学基金项目，编号：61363035，主持，2014-2017
4. 面向多源异构组学数据的泛癌驱动通路识别问题研究，广西自然科学基金项目，编号：2022GXNSFAA035625，主持，2022-2025
5.基于新一代测序技术的病毒准种单体型组装算法研究，广西自然科学基金项目，编号：2015GXNSFAA139288，主持，2015-2018
6.生物信息处理的组装算法研究，广西多源信息挖掘与安全重点实验室系统性研究基金项目（14-A-03-02），主持，2014-2016
7.多倍体个体SNP 单体型检测的有效计算模型和算法研究，广西高等学校科学技术项目(2013YB028)，主持，2013-2015
8.基于进化计算的三倍体个体单体型检测算法研究，广西自然科学基金项目（2011GXNSFB018068）主持，2011- 2014
9.地方高校数据库系列课程的整合与优化，广西高等教育教学改革工程一般A类项目（2012JGA120），主持，2012-2014
10.生物信息学中的相关组合理论和算法研究，国家自然科学基金重点项目（60433020），主要参与，2005-2008
主要科研论文
1 Xiaorong Chen, Jingli Wu*, Zheng Deng, Gaoshi Li: A model and multi-core parallel co-evolution algorithm for identifyingcancer driver pathways. Engineering Applications of Artificial Intelligence, 134: 108658 (2024) (中科院SCI二区)
2 Shiyu Deng, Jingli Wu*, Gaoshi Li, Jiafei Liu, Yumeng Zhao: ICDM-GEHC: identifying cancer driver module based on graphembedding and hierarchical clustering. Complex & Intelligent Systems, 10(3).DOI:10.1007/s40747-023-01328-5 (2024) (中科院SCI二区)
3 Rongyuan Li, Jingli Wu*, Gaoshi Li, Jiafei Liu, Jinlu Liu, Junbo Xuan, Zheng Deng: SIGRN: Inferring Gene Regulatory Network with SoftIntrospective Variational Autoencoders, Int. J. Mol. Sci. 25, 12741 (2024) (中科院SCI二区)
4 Jingli Wu, Qinghua Nie, Gaoshi Li, Kai Zhu:Identifying driver pathways based on a parameter-free model and a partheno-genetic algorithm. BMC Bioinform. 24(1): 211 (2023) （CCF C）
5 Rongyuan Li, Jingli Wu*, Gaoshi Li, Jiafei Liu, Junbo Xuan, Qi Zhu:Mdwgan-gp: data augmentation for gene expression data based on multiple discriminator WGAN-GP. BMC Bioinform. 24(1): 427 (2023) （CCF C）
6 Kai Zhu, Jingli Wu*, Gaoshi Li, Xiaorong Chen, Michael Yourong Luo:A model and cooperative co-evolution algorithm for identifying driver pathways based on the integrated data and PPI network. Expert Syst. Appl. 212: 118753 (2023) (中科院SCI一区)
7 Jingli Wu, Xiaorong Chen, Gaoshi Li, Zheng Deng, Kai Zhu. A Nonlinear Model and an Algorithm for Identifying Cancer Driver Pathways. Appl. Soft Comput. 129: 109578 (2022) (中科院SCI二区)
8 Jingli Wu, Cong Wu, Gaoshi Li. Identifying common driver modulesby equilibrating coverage and mutual exclusivity across pan-cancer data. Neurocomputing 492: 408-420 (2022) (中科院SCI二区)
9 Jingli Wu, Qi Zhang, Gaoshi Li. Identification of Cancer-RelatedModule in Protein-Protein Interaction Networks Based on GenePrioritization. Journal of Bioinformatics and Computational Biology.https://doi.org/10.1142/S0219720021500311, 2022, 20(01):2150031.（SCI）
10 Jingli Wu, Jifan Yang, Gaoshi Li, Jinyan Wang. IDM-SPS:Identifying driver module with somatic mutation, PPI network and subcellularlocalization, Engineering Applications of Artificial Intelligence. https://doi.org/10.1016/j.engappai.2021.104482 (中科院SCI二区)
11 Jingli Wu, Kai Zhu, Gaoshi Li,YinyanWang, Qirong Cai. A Modeland Algorithm for Identifying Driver Pathways Based on Weighted Non-binaryMutation Matrix, Applied Intelligence. 2021, DOI:10.1007/s10489-021-02330-5(中科院SCI二区)
12 Jingli Wu, Ke Pan, Gaoshi Li, Kai Zhu, Qirong Cai. Two NovelModels and a Parthenogenetic Algorithm for Detecting Common Driver Pathwaysfrom Pan-Cancer Data, Engineering Applications of Artificial Intelligence,Volume 96, November 2020, 104010 (中科院SCI二区)
13 Jingli Wu,Yong Wu. Practical Algorithms for allocating theroadside infrastructure in VANETs, IET Intelligent Transport Systems,2020,14(2): 103-109（SCI）
14 Jingli Wu, Ke Pan, Kai Zhu, Qirong Cai. Identifying Common DriverPathways based on Pan-cancer Data.Proceedings of 2019 IEEE InternationalConference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2019), San Diego,California, USA, November 18-21 , 2019, pp. 542--547. (CCF B 类会议，EI)
15 Jingli Wu, Qirong Cai, Jinyan Wang, Yuanxiu Liao.Identifyingmutated driver pathways in cancer by integrating multi-omics data, the 17thAsia Pacific Bioinformatics Conference (APBC 2019), Computational Biology andChemistry, 2019, 80: 159-167 （CCF C类会议， SCI+EI）
16 Jingli Wu,Qian Zhang. A Fast and Accurate Enumeration-basedAlgorithm for Haplotyping a Triploid Individual, Algorithms for MolecularBiology, 2018,13(1):10 （SCI）
17 Jingli Wu,Yong Wu. A parthenogenetic algorithm for Deploying theRoadside Units in Vehicle Networks，In:Liu W., Giunchiglia F., Yang B. (eds) Proceedings of Knowledge Science,Engineering and Management, 2018. （CCF C类会议，EI）
18 Jingli Wu, Xixi Chen and Xianchen Li. Haplotyping a singletriploid individual based on genetic algorithm. Bio-MedicalMaterials and Engineering, 2014, 24(6): 3753–3762. （SCI）
19 Jingli Wu, Binbin Liang. A Fast and Accurate Algorithm for Individual haplotype Reconstruction, Journal of Bioinformatics and Computational Biology,11(4): 1350010, 2013. （SCI）
20 JingliWu，Jian Xin Wang，Jian’er Chen. A Heuristic Algorithm for Haplotype Reconstructionfrom Aligned Weighted SNP Fragments. International Journal of BioinformaticsResearch and Applications, 2013,9(1): 13-24
21 JingliWu, Jianxin Wang and Jian’er Chen. A ParthenogeneticAlgorithm for Single Individual SNP Haplotyping. Engineering Applications ofArtificial Intelligence, 2009, 22(3):401-406 (中科院SCI二区)
22 JingliWu, Jianxin Wang and Jian’er Chen. A Practical AlgorithmBased on Particle Swarm Optimization for Haplotype Reconstruction. AppliedMathematics and Computation, 2009, 28(2): 363-372 (中科院SCI一区)